Fakültemiz Bakanlar Kurulu’nun 25.06.2019 tarihli 30812 sayılı Resmi Gazete yayını ile kurulmuştur. 2023-2024 Eğitim-Öğretim döneminde eğitime başlamıştır. Eczacılık Fakültesinde Temel Eczacılık Bilimleri Bölümü, Eczacılık Meslek Bilimleri Bölümü ve Eczacılık Teknolojisi Bölümü olmak üzere üç bölüm ve bunlara bağlı olarak Analitik Kimya, Biyokimya, Farmasötik Mikrobiyoloji, Temel Eczacılık Bilimleri, Farmakognozi, Farmasötik Toksikoloji, Farmasötik Kimya, Farmakoloji, Farmasötik Botanik, Eczacılık İşletmeciliği, Klinik Eczacılık, Farmasötik Teknoloji, Radyofarmasi, ve Farmasötik Biyoteknoloji Anabilim Dalları bulunmaktadır.
Eczacılık Fakültesi’nde beş yıllık lisans eğitimi programı uygulanmaktadır. Öğrenci mezun olabilmek için 200 ulusal kredi ve 300 AKTS ile (Ondokuz Mayıs Üniversitesi Ön Lisans Ve Lisans Eğitim-Öğretim Yönetmeliği gereği) tamamlamalıdır. Öğrenciler ikinci sınıfın sonundan itibaren üç dönem halinde yaptıkları yaz stajları (hastane, serbest eczane ve endüstri) ve onuncu dönemde yaptıkları hastane/serbest eczane veya endüstri stajları ile staj eğitimlerini tamamlamaktadırlar. Akademik program, “Türkiye Yükseköğretim Yeterlilikler Çerçevesi (TYYÇ) Temel Alan Yeterlilikleri” kapsamındaki “Temel Alan Kodu:72” olan “Sağlık” belgesinin “Sağlık Temel Alanı Lisans Yeterlilikleri (Akademik Ağırlık)” ve/veya “Sağlık Temel Alanı Lisans Yeterlilikleri (Mesleki Ağırlık)” bölümlerine uygun olarak hazırlanmıştır. EczÇEP-2019’a uyumlu olarak da tüm ders müfredatları düzenlenmiştir.